LSCM激光共聚焦顯微鏡應(yīng)用廣泛，在生命科學(xué)、醫(yī)學(xué)研究中日益受到重視。一方面可以觀察細(xì)胞或亞細(xì)胞形態(tài)結(jié)構(gòu)等研究，如檢測(cè)蛋白質(zhì)、抗體及其他大分子;檢測(cè)細(xì)胞凋亡;細(xì)胞器的觀察和測(cè)定(線粒體、溶酶體、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)和高爾基體);檢測(cè)細(xì)胞融合;

　　觀測(cè)細(xì)胞骨架;檢測(cè)細(xì)胞間隙連接通訊;檢測(cè)細(xì)胞或組織內(nèi)脂肪;進(jìn)行細(xì)胞或組織結(jié)構(gòu)的三維重構(gòu)等。

　　同時(shí)，LSCM還可以進(jìn)行活體細(xì)胞或組織功能的實(shí)時(shí)動(dòng)態(tài)檢測(cè)，如測(cè)定細(xì)胞內(nèi)鈣變化;測(cè)定細(xì)胞PH 變化;檢測(cè)膜電位變化;藥物篩選、檢測(cè)熒光漂白恢復(fù)等。

　　除此之外，LSCM在交叉學(xué)課中的高分辨率成像，如神經(jīng)科學(xué)、藥理研究、材料研究、化工原料等也廣泛應(yīng)用。